Identification of pulmonary PDGFRα-positive fibroblast specific miRNA and mRNA expression profiles during postnatal lung development

Auteurs

• Daria Agnieszka Dontireddy

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Der Prozess der Alveolarisierung unterliegt strenger Regulation, an der verschiedene Subpopulationen pulmonaler Fibroblasten beteiligt sind, darunter Myofibroblasten, Lipofibroblasten und PDGFRa-positive Fibroblasten. Diese Subtypen übernehmen zeitabhängig spezifische Funktionen während der Lungenentwicklung, wobei PDGFRa-positive Zellen entscheidend zur Septenbildung und Myofibroblasten-Differenzierung beitragen. Die in vivo Deletion von PDGF-A stört die Alveolarisierung in Mäusen. Ziel der Arbeit ist es, die miRNA- und mRNA-Expressionsprofile von PDGFRa-positiven Fibroblasten zu verschiedenen Zeitpunkten der Lungenentwicklung zu bestimmen. Die Hypothese besagt, dass der Phänotyp und die Funktionen dieser Fibroblasten durch Änderungen der Expressionsprofile reguliert werden. PDGFRa-positive Fibroblasten wurden isoliert und eine miRNome-Analyse ergab 98 signifikant regulierte miRNAs. 56 miRNAs waren hochreguliert an P5 im Vergleich zu W6. In silico Analysen identifizierten deren Funktionen und Zielgene. Die Analyse des Transcriptoms durch Next-Generation Sequencing zeigte Gen-Kandidaten mit unterschiedlicher Expression während der Alveolarisierung im Vergleich zur adulten Lunge. Die Ergebnisse deuten darauf hin, dass sich der molekulare Phänotyp und die Funktionen von PDGFRa-positiven Zellen zwischen der Alveolarisierung und der adulten Lunge stark unterscheiden. Relevante miRNAs und Gen-Kandidaten wurden identifiziert, die fü

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• Année de publication: 2015